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Ph.D. Thesis

Titre
Du support générique d'opérateurs de composition dans les modèles de composants logiciels, application au calcul à haute performance.
Auteurs
Julien Bigot url
Détail
Du support générique d'opérateurs de composition dans les modèles de composants logiciels, application au calcul scientifique, INSA de Rennes, Décembre 2010
Note
(in french)
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Journal articles

titre
Building and Auto-Tuning Computing Kernels: Experimenting with BOAST and StarPU in the GYSELA Code
auteur
Julien Bigot, Virginie Grandgirard, Guillaume Latu, Jean-François Méhaut, Luís Felipe Millani, Chantal Passeron, Steven Quinito Masnada, Jérôme Richard, Brice Videau
article
ESAIM: Proceedings and Surveys, EDP Sciences, 2018, CEMRACS 2016 - Numerical challenges in parallel scientific computing, 63 (2018), pp.152 - 178. 〈https://www.esaim-proc.org〉. 〈10.1051/proc/201863152〉
DOI
DOI : 10.1051/proc/201863152
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https://hal.inria.fr/hal-01909325/file/CEMRACS.pdf BibTex
titre
Extensibility and Composability of a Multi-Stencil Domain Specific Framework
auteur
Hélène Coullon, Julien Bigot, Christian Pérez
article
International Journal of Parallel Programming, Springer Verlag, 2017, 〈10.1007/s10766-017-0539-5〉
DOI
DOI : 10.1007/s10766-017-0539-5
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01650998/file/article.pdf BibTex
titre
A Hybrid Monte Carlo Scheme for Multibackbone Protein Design
auteur
Julien Bigot, Karen Druart, Edouard Audit, Thomas Simonson
article
Journal of Chemical Theory and Computation, American Chemical Society, 2016, 〈10.1021/acs.jctc.6b00421〉
DOI
DOI : 10.1021/acs.jctc.6b00421
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titre
A 5D gyrokinetic full-f global semi-lagrangian code for flux-driven ion turbulence simulations
auteur
Virginie Grandgirard, Jérémie Abiteboul, Julien Bigot, Thomas Cartier-Michaud, Nicolas Crouseilles, Guilhem Dif-Pradalier, Charles Erhlacher, Damien Esteve, Xavier Garbet, Philippe Ghendrih, Guillaume Latu, Michel Mehrenberger, Claudia Norscini, Chantal Passeron, Fabien Rozar, Yanick Sarazin, Eric Sonnendrücker, A. Strugarek, David Zarzoso
article
Computer Physics Communications, Elsevier, 2016, 207, pp.35-68. 〈10.1016/j.cpc.2016.05.007〉
DOI
DOI : 10.1016/j.cpc.2016.05.007
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https://hal-cea.archives-ouvertes.fr/cea-01153011/file/article_GYSELA_2015_long.pdf BibTex
titre
A low level component model easing performance portability of HPC applications
auteur
Julien Bigot, Zhengxiong Hou, Christian Pérez, Vincent Pichon
article
Computing, Springer Verlag, 2014, 96 (12), pp.1115-1130. 〈http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00607-013-0368-3〉. 〈10.1007/s00607-013-0368-3〉
DOI
DOI : 10.1007/s00607-013-0368-3
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https://hal.inria.fr/hal-00911231/file/paper.pdf BibTex
titre
Towards Scalable Data Management for Map-Reduce-based Data-Intensive Applications on Cloud and Hybrid Infrastructures
auteur
Gabriel Antoniu, Julien Bigot, Cristophe Blanchet, Luc Bougé, François Briant, Franck Cappello, Alexandru Costan, Frédéric Desprez, Gilles Fedak, Sylvain Gault, Kate Keahey, Bogdan Nicolae, Christian Pérez, Anthony Simonet, Frédéric Suter, Bing Tang, Raphael Terreux
article
International Journal of Cloud Computing, Inderscience Publishers, 2013, 2 (2/3), 〈10.1504/IJCC.2013.055265〉
DOI
DOI : 10.1504/IJCC.2013.055265
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Conference papers

titre
Scaling and optimizing the Gysela code on a cluster of many-core processors
auteur
Guillaume Latu, Yuuichi Asahi, Julien Bigot, Tamás Fehér, Virginie Grandgirard
article
SBAC-PAD 2018, WAMCA workshop, Sep 2018, Lyon, France. SBAC-PAD 2018 proceedings. 〈IEEE〉
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https://hal.inria.fr/hal-01719208/file/wamca18_gl.pdf BibTex
titre
InKS, a Programming Model to Decouple Performance from Algorithm in HPC Codes
auteur
Ksander Ejjaaouani, Olivier Aumage, Julien Bigot, Michel Mehrenberger, Hitoshi Murai, Masahiro Nakao, Mitsuhisa Sato
article
Repara 2018 - 4th International Workshop on Reengineering for Parallelism in Heterogeneous Parallel Platforms, Aug 2018, Turin, Italy. pp.1-12
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01890132/file/papier.pdf BibTex
titre
Combining Both a Component Model and a Task-based Model for HPC Applications: a Feasibility Study on GYSELA
auteur
Olivier Aumage, Julien Bigot, Hélène Coullon, Christian Pérez, Jérôme Richard
article
17th IEEE/ACM International Symposium on Cluster, Cloud and Grid Computing (CCGrid)., May 2017, Madrid, Spain
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titre
Benefits of SMT and of Parallel Transpose Algorithm for the Large-Scale GYSELA Application
auteur
Guillaume Latu, Julien Bigot, Nicolas Bouzat, Judit Gimenez, Virginie Grandgirard
article
PASC '16 - Proceedings of the Platform for Advanced Scientific Computing Conference, Jun 2016, Lausanne, France. ACM Press, 〈10.1145/2929908.2929912〉
DOI
DOI : 10.1145/2929908.2929912
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titre
From DSL to HPC Component-Based Runtime: A Multi-Stencil DSL Case Study
auteur
Julien Bigot, Hélène Coullon, Christian Pérez
article
WOLFHPC 2015 (Fifth International Workshop on Domain-Specific Languages and High-Level Frameworks for High Performance Computing), Nov 2015, co-located with SC'15, Austin, Texas, United States. pp.10, 2015, 〈10.1145/2830018.2830020〉
DOI
DOI : 10.1145/2830018.2830020
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https://hal.inria.fr/hal-01215992/file/article.pdf BibTex
titre
An approach to increase reliability of hpc simulation, application to the GYSELA5D Code
auteur
Julien Bigot, Guillaume Latu, Thomas Cartier-Michaud, Virginie Grandgirard, Chantal Passeron, Fabien Rozar
article
Martin Campos Pinto and Frédérique Charles. ESAIM: Proceedings and Surveys, Jul 2014, CIRM – Centre International de Rencontres Mathématiques, Marseille, France. EDP Sciences, pp.191-210, 2016, CEMRACS 2014 – Numerical Modeling of Plasmas. 〈10.1051/proc/201653015〉
DOI
DOI : 10.1051/proc/201653015
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https://hal-cea.archives-ouvertes.fr/cea-01305504/file/proc165315.pdf BibTex
titre
Evaluating Kernels on Xeon Phi to accelerate GYSELA application
auteur
Guillaume Latu, Matthieu Haefele, Julien Bigot, Virginie Grandgirard, Thomas Cartier-Michaud, Fabien Rozar
article
Martin Campos Pinto and Frédérique Charles. ESAIM: PROCEEDINGS AND SURVEYS, Jul 2014, CIRM – Centre International de Rencontres Mathématiques, Marseille, France. pp.211-231, 2016, CEMRACS 2014 – Numerical Modeling of Plasmas. 〈10.1051/proc/201653013〉
DOI
DOI : 10.1051/proc/201653013
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https://hal-cea.archives-ouvertes.fr/cea-01305499/file/proc165313.pdf BibTex
titre
A Low Level Component Model Enabling Performance Portability of HPC Applications
auteur
Julien Bigot, Zhengxiong Hou, Christian Pérez, Vincent Pichon
article
5th International Workshop on Multi-Core Computing Systems, Nov 2012, Salt Lake City, United States. 2012
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titre
An asynchronous writing method for restart files in the gysela code in prevision of exascale systems
auteur
Olivier Thomine, Julien Bigot, Virginie Grandgirard, Guillaume Latu, Chantal Passeron, Fabien Rozar
article
CEMRACS 2012, Jul 2012, Luminy, France. 43, 2013, ESAIM: Proc. 〈10.1051/proc/201343007〉
DOI
DOI : 10.1051/proc/201343007
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https://hal.inria.fr/hal-01048745/file/proc134307.pdf BibTex
titre
Scaling GYSELA code beyond 32K-cores on Blue Gene/Q
auteur
Julien Bigot, Virginie Grandgirard, Guillaume Latu, Chantal Passeron, Fabien Rozar, Olivier Thomine
article
ESAIM: PROCEEDINGS, Jul 2012, Luminy, France. CEMRACS 2012, pp.117-135, 2013, 43. 〈10.1051/proc/201343007〉
DOI
DOI : 10.1051/proc/201343007
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https://hal.inria.fr/hal-01050322/file/proc134308.pdf BibTex
titre
Towards Scalable Data Management for Map-Reduce-based Data-Intensive Applications on Cloud and Hybrid Infrastructures
auteur
Gabriel Antoniu, Julien Bigot, Christophe Blanchet, Luc Bougé, François Briant, Franck Cappello, Alexandru Costan, Frédéric Desprez, Gilles Fedak, Sylvain Gault, Kate Keahey, Bogdan Nicolae, Christian Pérez, Anthony Simonet, Frédéric Suter, Bing Tang, Raphael Terreux
article
1st International IBM Cloud Academy Conference - ICA CON 2012, Apr 2012, Research Triangle Park, North Carolina, United States. 2012
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https://hal.inria.fr/hal-00684866/file/ICACON2012-MapReduce.pdf BibTex
titre
On Model-Driven Engineering to implement a Component Assembly Compiler for High Performance Computing
auteur
Julien Bigot, Christian Pérez
article
Ileana Ober. Journées sur l'Ingénierie Dirigée par les Modèles, IDM 2011, Jun 2011, Lille, France. IRIT - UMR 5505 - CNRS-INP-UPS-UT1, 2011, Acte des 7èmes journées sur l'Ingénierie Dirigée par les Modèles, IDM 2011
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https://hal.inria.fr/inria-00606511/file/jbigot-cperez-IDM2011.pdf BibTex
titre
Increasing Reuse in Component Models through Genericity
auteur
Julien Bigot, Christian Pérez
article
Stephen H. Edwards and Gregory Kulczycki. Proceedings of the 11th International Conference on Software Reuse, ICSR '09, Sep 2009, Falls Church, VA, United States. Springer-Verlag, pp.21-30, 2009, Formal Foundations of Reuse and Domain Engineering. 〈http://www.springerlink.com/content/x133p42570568328/〉. 〈10.1007/978-3-642-04211-9〉
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-04211-9
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titre
On Abstractions of Software Component Models for Scientific Applications
auteur
Julien Bigot, Hinde Lilia Bouziane, Christian Pérez, Thierry Priol
article
Eduardo César and Michael Alexander and Achim Streit and Jesper Larsson Träff and Christophe Cérin and Andreas Knüpfer and Dieter Kranzlmüller and Shantenu Jha. Euro-Par 2008 Workshops - Parallel Processing, Aug 2008, Las Palmas de Gran Canaria, Spain. Springer-Verlag, pp.438-449, 2009, 〈http://www.springerlink.com/content/h52952747830h822/〉. 〈10.1007/978-3-642-00955-6〉
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-00955-6
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titre
Enabling collective communications between components
auteur
Julien Bigot, Christian Pérez
article
CompFrame '07: Proceedings of the 2007 symposium on Component and framework technology in high-performance and scientific computing, 2007, Montreal, Quebec, Canada. ACM Press, pp.121-130, 2007, 〈http://portal.acm.org/citation.cfm?id=1297385.1297406〉. 〈10.1145/1297385.1297406〉
DOI
DOI : 10.1145/1297385.1297406
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Book sections

titre
High Performance Composition Operators in Component Models
auteur
Julien Bigot, Christian Pérez
article
Ian Foster, Wolfgang Gentzsch, Lucio Grandinetti, Gerhard R. Joubert. High Performance Computing: From Grids and Clouds to Exascale, 20, IOS Press, pp.182 - 201, 2011, Advances in Parallel Computing, 978-1-60750-802-1. 〈10.3233/978-1-60750-803-8-182〉
DOI
DOI : 10.3233/978-1-60750-803-8-182
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https://hal.inria.fr/hal-00692584/file/ohpcocm.pdf BibTex

Reports

titre
The Multi-Stencil Language: orchestrating stencils with a mesh-agnostic DSL
auteur
Hélène Coullon, Julien Bigot, Christian Pérez
article
[Research Report] RR-8962, Inria - Research Centre Grenoble – Rhône-Alpes. 2016, pp.30
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https://hal.inria.fr/hal-01380607/file/RR-8962.pdf BibTex
titre
A Low Level Component Model enabling Resource Specialization of HPC Applications
auteur
Julien Bigot, Zhengxiong Hou, Christian Pérez, Vincent Pichon
article
[Research Report] RR-7966, INRIA. 2012, pp.20
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https://hal.inria.fr/hal-00698573/file/RR-7966.pdf BibTex
titre
Enabling Connectors in Hierarchical Component Models
auteur
Julien Bigot, Christian Pérez
article
[Research Report] RR-7204, INRIA. 2010
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https://hal.inria.fr/inria-00456608/file/RR-7204.pdf BibTex
titre
Increasing Reuse in Component Models through Genericity
auteur
Julien Bigot, Christian Pérez
article
[Research Report] RR-6941, INRIA. 2009, pp.15
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https://hal.inria.fr/inria-00388508/file/RR-6941.pdf BibTex
titre
A Generic Model Driven Methodology for Extending Component Models
auteur
Julien Bigot, Christian Pérez
article
[Research Report] RR-6979, INRIA. 2009, pp.27
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https://hal.inria.fr/inria-00401656/file/RR-6979.pdf BibTex